Corso di Laurea Specialistica in Chimica delle Molecole di Interesse Biologico

Struttura e Dinamica di Biomolecole - 2007/2008

Aprire una sessione facendo login con il nome del vostro utente e password.
Aprire un terminale usando il menù principale del Desktop.
Ripassare la ``sintassi generale di un comando'' [tab. 4.1]
Ripassare il ``percorso assoluto e relativo'' per indicare file e directory [fig. 4.1]
Ripassare i comandi per la ``gestione essenziale di file e directory'' [tab. 4.2]
Copiare il file ~signorini/etc/bashrc.global su ~/.bashrc
Copiare il file ~signorini/etc/init.el su ~/.emacs
uscire dal terminale e rientrare

differenza tra editor di testo e word processor typeset@protect @@footnote SF@gobble@opt sez. 4.5.1
Lanciare emacs, col comando
emacs
provare a uscire
rientrare lanciando il comando in background
emacs &
osservare le varie aree dello schermo
1. barra menu
2. area di lavoro: il buffer
3. riga di stato (Mode Line)
4. minibuffer
menu, scorciatoie e comandi ``complessi''
help: Apropos, Key, Whereis (locate); Tutorial
differenza tra buffer e file
editare il file ~/.plan
1. inserire n.o matricola e codice corso di laurea
``editare'' una directory: dired

Ripassaretypeset@protect @@footnote SF@gobble@opt sez. 6.1; cfr. anche http://www.gnuplot.infohttp://www.gnuplot.info come fare a

Si usa il programma canon

creare la directory canonic sotto la propria home
copiare il file di dati ~signorini/canonic/data/c.in su ~/canonic/
copiare il programma ~signorini/canonic/canonsu ~/canonic/
editare il file di dati:
1. modificare il numero di celle e il numero di gettoni in modo da ottenere un diverso rapporto
2. eventualmente, modificare il numero di mosse e la frequenza di campionamento
lanciare il programma con

canon c
esaminare i file di output c.out e c.tbl con emacs

Usare gnuplot per visualizzare i risultati e ottenere un fit sulla funzione

$\begin{displaymath} P(x)=\frac{1}{Q}e^{-\beta x}\end{displaymath}$

gnuplot> p(x)=1./q*exp(-beta*x)

gnuplot> fit p(x) 'c.out' u 0:1 via q,beta

gnuplot> plot 'c.out' u 0:1, p(x)

Stampare il grafico con

gnuplot> set term jpeg

gnuplot> set out 'figura.jpeg'

gnuplot> !a2ps figura.jpeg

Usando OpenOffice.org scrivere una relazione sull'esercitazione che contenga: